Djibouti est une république de type présidentiel et pluraliste. Le Président de la République qui est aussi chef du gouvernement, est élu au suffrage universel direct pour 6 ans renouvelable une seule fois. Il nomme les différents ministres sur proposition du premier Ministre et peut les révoquer.

Les Ministres sont chargés de mettre en oeuvre la politique du gouvernement. Le pouvoir législatif revient à l'Assemblée Nationale constituée d’une chambre unique avec 65 députés élus au suffrage universel sur une liste pour 5 ans.
Il y a une indépendance réciproque du Président de la République et de l'Assemblée Nationale.

Le Président ne dispose donc pas du pouvoir de prononcer la dissolution de l'assemblée et celle - ci ne peut, de son côté, mettre en cause la responsabilité du Président.
Les autres institutions prévues par la constitution sont le Conseil Constitutionnel, le Conseil Supérieur de la Magistrature, la Haute Cour de Justice et le Médiateur de la République.